| 番号 |
都道府県 |
公立の（自然史系）博物館 |
私立の（自然史系）博物館 |
| 1 |
北海道 |
北海道穂別町立博物館 釧路市立博物館
市立函館博物館
三笠市立博物館
北海道・足寄町立動物化石博物館
沼田町化石館 中川町エコミュージアムセンター |
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| ２ |
青森県 |
中里町立博物館 |
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| ３ |
秋田県 |
秋田県立博物館
秋田大学鉱山学部附属鉱業博物館 |
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| ４ |
岩手県 |
岩手県立博物館 大船渡市立博物館
北上市立博物館 |
久慈琥珀博物館 |
| ５ |
山形県 |
山形県立博物館 |
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| ６ |
宮城県 |
仙台市科学館
東北大学理学部自然史標本館 |
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| ７ |
福島県 |
福島県立博物館 いわき市アンモナイトセンター
いわき市石炭・化石館 |
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| ８ |
新潟県 |
新潟県立自然科学館
糸魚川市フォッサマグナミュージアム |
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| ９ |
栃木県 |
栃木県立博物館 木の葉化石園 |
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| １０ |
茨城県 |
茨城県自然博物館 地質調査所地質標本館 |
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| １１ |
群馬県 |
群馬県立自然史博物館 恐竜王国中里 |
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| １２ |
埼玉県 |
埼玉県立自然史博物館 |
ユネスコ村大恐竜探検館◎ |
| １３ |
千葉県 |
千葉県立中央博物館 |
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| １４ |
東京都 |
国立科学博物館
東京大学総合研究博物館
東京都高尾自然科学博物館
林原科学自然博物館 |
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| １５ |
神奈川県 |
神奈川県立生命の星・地球博物館◎
横須賀市自然・人文博物館 |
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| １６ |
長野県 |
信州新町化石博物館 長野市立博物館
野尻湖ナウマンゾウ博物館 阿南町化石館
戸隠山地質化石館 信州新町化石博物館
四賀村化石館 ミュージアム鉱研 地球の宝石箱 |
柏木化石博物館 |
| １７ |
山梨県 |
山梨県立科学館◎ |
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| １８ |
静岡県 |
（歴史系博物館◎と科学館◎は浜松市にあります） |
東海大学自然史博物館◎
アンモナイト博物館
奇石博物館 |
| １９ |
愛知県 |
豊橋市自然史博物館◎ 生命の海科学館
鳳来寺町立鳳来寺山自然科学博物館 |
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| ２０ |
岐阜県 |
岐阜県瑞浪市化石博物館 岐阜県博物館
ひだ自然館 金生山化石館 |
浅見化石会館 |
| ２１ |
富山県 |
富山市科学文化センター
朝日町宮崎自然博物館 |
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| ２２ |
石川県 |
北陸恐竜化石博物館 白山恐竜パーク白峰 |
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| ２３ |
福井県 |
福井市自然史博物館 福井県立恐竜博物館 |
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| ２４ |
滋賀県 |
滋賀県立琵琶湖博物館◎ 多賀自然と文化の館 |
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| ２５ |
三重県 |
三重県立博物館 |
志摩マリンランド |
| ２６ |
奈良県 |
（歴史博物館があります） |
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| ２７ |
和歌山県 |
和歌山県立自然博物館 |
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| ２８ |
大阪府 |
大阪市立自然史博物館 |
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| ２９ |
京都府 |
京都大学総合博物館
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益富地学会館 |
| ３０ |
兵庫県 |
兵庫県立人と自然の博物館 玄武洞ミュージアム
おもしろ昆虫化石館
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| ３１ |
鳥取県 |
鳥取県立博物館
奥出雲多根自然博物館 |
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| ３２ |
島根県 |
島根県立三瓶自然館 |
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| ３３ |
岡山県 |
倉敷市立自然史博物館 成羽町美術館
笠岡市立カブトガニ博物館 日本化石資料館
なぎビカリアミュージアム |
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| ３４ |
広島県 |
（歴史博物館があります） |
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| ３５ |
山口県 |
山口県立山口博物館 美祢市化石館 |
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| ３６ |
香川県 |
香川県自然科学館 |
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| ３７ |
徳島県 |
徳島県立博物館 |
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| ３８ |
高知県 |
佐川地質館 横倉山自然の森博物館 |
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| ３９ |
愛媛県 |
愛媛県立博物館 |
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| ４０ |
福岡県 |
北九州市自然史博物館 |
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| ４１ |
佐賀県 |
佐賀県立博物館 |
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| ４２ |
長崎県 |
（美術博物館があります） |
長崎バイオパーク |
| ４３ |
大分県 |
（歴史博物館があります） |
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| ４４ |
熊本県 |
熊本市立熊本博物館 御船町恐竜博物館
御所浦白亜紀資料館 |
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| ４５ |
宮崎県 |
宮崎県総合博物館 |
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| ４６ |
鹿児島県 |
鹿児島県立博物館 |
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| ４７ |
沖縄県 |
沖縄・名護博物館 |
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