英語の学び場
英文法《初級(高校入試レベル)
主語と動詞の呼応(一致)

.6: Everything are fine now.

everything”(何でもみな,すべてのこと)が主語にくる場合、動詞は、単数扱いとなります。
よって、問題文は、誤り。”Everything is fine now.”(今のところすべてが順調です)とすれば正しい。